Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TROQ12816 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TROQ12816 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TROQ12816 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TROQ12816 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TROQ12816 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TROQ12816 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TROQ12816 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TROQ12816 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TROQ12816 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
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