Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBRQ0VD83 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms