Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RASGEF1BQ0VAM2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms