Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms