Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TGM3Q08188 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms