Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms