Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOS1Q07889 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms