Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms