Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ERCC6Q03468 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERCC6Q03468 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms