Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPCQ03188 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms