Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms