Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TNFRSF17Q02223 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms