Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XPCQ01831 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XPCQ01831 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XPCQ01831 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms