Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms