Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms