Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAMQ00059 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms