Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms