Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNAP25P60880 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms