Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK4P57078 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK4P57078 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK4P57078 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms