Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF10P55107 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF10P55107 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDF10P55107 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms