Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNQ1P51787 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms