Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms