Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB28P51157 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB28P51157 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms