Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM1P49642 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms