Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYB561P49447 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms