Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK1A1P48729 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms