Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTDSS1P48651 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTDSS1P48651 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms