Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCLMP48507 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCLMP48507 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms