Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIP4K2AP48426 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms