Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GNPDA1P46926 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms