Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms