Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL1P40616 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ARL1P40616 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms