Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCKARP32238 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms