Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA10P31260 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms