Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRMP28827 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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