Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA3P26006 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms