Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMA3P25788 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms