Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP1P23763 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAMP1P23763 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP1P23763 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP1P23763 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms