Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HRCP23327 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HRCP23327 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HRCP23327 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HRCP23327 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HRCP23327 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HRCP23327 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms