Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFE3P19532 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TFE3P19532 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TFE3P19532 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms