Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD8P13378 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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