Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CALCBP10092 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CALCBP10092 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CALCBP10092 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCBP10092 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms