Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTMAP06454 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTMAP06454 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTMAP06454 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTMAP06454 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTMAP06454 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTMAP06454 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms