Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04436 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04436 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04436 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04436 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04436 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04436 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms