Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX58O95786 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX58O95786 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms