Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms