Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PITX3O75364 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PITX3O75364 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PITX3O75364 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms