Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM20BO75063 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms