Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMD3O43242 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms