Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNPATO15228 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNPATO15228 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms